本次督察堅持以問題為導向，以《福建省貫徹落實中央環境保護督察反饋意見整改方案》為依據，堅決查處突出生態環境問題整改方案久議不決、推動不力、措施不到位、“表面整改”、“假裝整改”、“敷衍整改”等問題。重點督察五個方面內容：
1、國家和省委、省政府關于生態文明建設和環境保護決策部署貫徹落實情況，環境保護黨政同責和一崗雙責落實情況；
2、中央環保督察反饋問題（含信訪件）整改、整改過程中追責問責以及污染防治攻堅戰組織落實情況；
3、大氣環境質量情況，重點督察臭氧污染防治、柴油貨車污染治理等情況；
4、水環境質量情況，重點督察國省控斷面水質超標整治、劣Ⅴ類小流域整治、重點湖庫水華整治等情況；
5、國家督查組交辦的市級飲用水水源地存在問題，縣級及以下飲用水水源地環境整治、設區市城市黑臭水體整治（國家已督查的除外）情況。
本次督察主要采取現場檢查、資料調閱、座談問詢等方式，聚焦各級各部門履職情況。對已完成的整改任務，核實是否嚴格對標完全整改到位，是否仍然存在環境風險隱患；對正在整改的任務，核實是否存在整改推動不力、方案久議不決情況，是否未達到序時進度；對行業性、區域性整改任務，核實是否舉一反三，是否建立長效管理機制。對存在問題及時與地方政府及其相關部門會商分析，確保整改成效。督察結束后將形成督察報告上報省委、省政府，并公開曝光一批典型案例，對整改過程中存在推進不力、整改進度嚴重滯后、表面整改、假裝整改、敷衍整改的問題將移送問責。
